Design and Implementation of Ultra-micro Nucleic Acid Protein Analyzer / 中国医疗器械杂志

In this paper, a nucleic acid protein analyzer based on Lambert-Beer law and ultraviolet spectrophotometry is introduced, which is composed of ultraviolet monochromatic light generator, photoelectric signal detection module, vortex mixer, touch screen and embedded central controller. For ultra-micro measurement, a continuous-wavelength full-spectrum spectrophotometric detection circuit is designed in the hardware part. The transmitted light signal is collected by silicon photodiode, amplified and processed by subsequent circuit, and then transmitted to a single chip computer STM32F407VGT6 with CortexTM-M4 core after A/D conversion. The concentration and purity of nucleic acid protein are evaluated by assistant software detection algorithm. The instrument has the characteristics of compact size, flexible use, simple operation, high sensitivity and high detection efficiency. The experimental results show that the instrument has good sensitivity, repeatability and accuracy, and is suitable for the ultra-micro measurement of nucleic acid sample concentration, purity and protein concentration.

Procedimento do teste do ácido nucleico (NAT) em amostras de sangue de doador / Nucleic acid (NAT) test procedure in donor blood samples

PROCEDIMENTO: O Teste de Amplificação de Ácidos Nucleicos (NAT) é uma tecnologia desenvolvida para a detecção do ácido nucleico de agentes infecciosos. Os testes NAT desenvolvidos no Brasil foram implantados na rede de estabelecimentos de hematologia e hemoterapia (Hemorrede) para detecção do Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) e do Vírus da Hepatite tipo C (HCV), em bolsas de sangue destinadas à transfusão. A implantação do NAT, neste caso, tem o propósito de reduzir o risco de transmissão de agentes virais transmissíveis por transfusão de sangue, como HIV e HCV, uma vez que é possível a detecção mais precoce destes agentes infecciosos em doações realizadas durante o período próximo à contaminação, porém, ainda em janela imunológica (antes da soro-conversão). Em conjunto com os testes sorológicos a implementação do NAT em estabelecimentos de hemoterapia é um consenso mundial visando garantir maior segurança transfusional e auxiliar na atualização dos dados epidemiológicos destas doenças. CRITÉRIOS PARA VALIDAÇÃO DOS ESTABELECIMENTOS DE HEMOTERAPIA: Os critérios para validação dos estabelecimentos de hemoterapia que receberiam a plataforma de testes, conjuntos diagnósticos (kits) registrados na ANVISA, o ressarcimento ao serviço público, no caso de realização do NAT para estabelecimentos de hemoterapia exclusivamente privados, a formalização dos contratos ou convênios a fim de definir as responsabilidades entre as partes foi estabelecida na Portaria GM/MS nº 79 de 31 de janeiro de 2003, que revogou as portarias anteriores de 2002. Essa última Portaria estabelecia ainda, que a Secretaria Executiva e a Secretaria de Atenção à Saúde (SAS), ambas do Ministério da Saúde (MS), ficavam autorizadas a emitir, conjuntamente, normas complementares e a adotar as providências necessárias para o custeio do NAT. Porém seu cumprimento foi inviabilizado devido à falta de recursos para aquisição e implantação dos testes. Em 2002, na Portaria GM/MS nº 112/04, foram definidas as efetivas ações para implantação gradativa do teste na Hemorrede brasileira. Assim, foi criado um consórcio público formado pelo Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos ­ Bio-Manguinhos/FIOCRUZ, pela Universidade Federal do Rio de Janeiro ­ UFRJ e Instituto de Biologia Molecular do Paraná ­ IBMP, sob demanda e direção nacional da SAS/MS, por meio da sua Coordenação Geral de Sangue e Hemoderivados (CGSH) para garantir o desenvolvimento do projeto produção de insumos com tecnologia nacional. IMPLANTAÇÃO E ADEQUAÇÃO DO CONJUNTO DIAGNÓSTICO: A implantação e adequação do conjunto diagnóstico desenvolvido por Bio-Manguinhos na rotina dos estabelecimentos de hemoterapia foi possível após a realização de etapas importantes como os estudos piloto e multicêntrico: a) Estudo Piloto: Projeto realizado no HEMOSC em 2008, para avaliação da plataforma brasileira de testes NAT multiplex HIV/HCV e seus processos na Hemorrede Pública, sendo possível identificar adaptações técnicas necessárias ao conjunto diagnóstico, aquisição de equipamentos para compor a plataforma NAT nos estabelecimentos de hemoterapia componentes do estudo multicêntrico, reformas nas estruturas físicas do HEMORIO/RJ; HEMOPE/PE e Fundação Pró-Sangue/SP e desenvolvimento do aplicativo informatizado para controle do envio e recebimento de amostras e liberação de resultados dos testes, o Gerenciador do Sistema Multicêntrico ­ GSM NAT. Ao final do estudo piloto, foram realizados cerca de 5.000 testes nas amostras coletadas e processadas no HEMOSC/SC; b) Estudo Multicêntrico: Realizado entre 2009 a 2010, com a participação de oito estabelecimentos de hemoterapia, definidos pelo Ministério da Saúde, sendo eles: HEMORIO ­ Rio de Janeiro, HEMOES ­ Espírito Santo, Fundação Pró-Sangue ­ São Paulo, Santos ­ SP, HEMOPE ­ Pernambuco, HEMONORTE ­ Rio Grande do Norte, HEMOÍBA ­ Paraíba e HEMOSC ­ Santa Catarina, este teve como principal ação avaliar a implantação na rotina, logística de transporte de amostras e liberação de resultados "on line". Ao final, o estudo multicêntrico testou cerca de 220 mil amostras. RECOMENDAÇÃO DA CONITEC: Diante do exposto, os membros da CONITEC presentes na 20ª reunião do plenário, realizada nos dias 06/11 e 07/11/2013, recomendaram a incorporação do procedimento: Teste do Ácido Nucleico (NAT) em amostras de sangue de doador. DECISÃO: PORTARIA Nº 13, de 15 de maio de 2014 - Torna pública a decisão de incorporar o procedimento do teste do ácido nucleico (NAT) em amostras de sangue de doador no Sistema Único de Saúde - SUS.

Diagnostic efficiency of toluidine blue with Lugol's iodine in oral premalignant and malignant lesions.

Background and Objectives: In vivo stains are prompt resources, which have emerged, in the recent years, to aid as clinical diagnostic tools in detecting early premalignant and malignant lesions. The aim of the study was to determine the diagnostic efficiency of toluidine blue with Lugol's iodine in oral premalignancies and malignancies and to evaluate the reliability of in vivo staining with toluidine blue and Lugol's iodine in the lesions at risk of malignancy. Materials and Methods: The study group comprised 30 subjects with clinically suspicious premalignant lesions and 30 subjects with clinically suspicious malignant lesions. All the lesions were stained consecutively with toluidine blue and Lugol's iodine and the dye retention were recorded with photographs. Depending on the retention of the dyes, the biopsy site was determined. The biopsy specimens were sent for histological confirmation and results were statistically analyzed. Results: The overall diagnostic accuracy of Lugol's iodine when used consecutively with toluidine blue stain in distinguishing premalignant lesions and malignant lesions was 90%. As the degree of differentiation of malignant lesions progressed toward more severity, they failed to show the retention of Lugol's iodine and the result was highly significant statistically, with a P value < 0.001. Interpretation and Conclusion: Lugol's iodine when used with toluidine blue helped in delineating the inflammatory lesions and was the mean source in determining clinically the degrees of differentiation of malignant lesions as the poorly differentiated malignant lesions without glycogen content failed to show Lugol's iodine retention. Toluidine blue with Lugol's iodine can be used as a pretherapeutic assessment of the biologic aggressiveness of the disease.

Genetic differences of E gene of a Thai strain of Japanese encephalitis virus that determine small plaque size phenotype but not neurovirulence in suckling mice.

Two small plaque variants of Japanese encephalitis virus (JEV), S4P9 and S9P10, were recovered from the wild type of JEV strain KE-093 using plaque purification in combination with the temperature-shift induction technique. Growth patterns of the S4P9 and S9P10 in BHK-21 cells as well as neurovirulence in suckling mice were similar to that of KE-093. An amino acid substitution, lysine for glutamic acid, was present in envelope protein at residue E-83 in the small plaque variants. This study shows that small plaque phenotype is not always associated with attenuation in vivo.

Giardia duodenalis: inter-strain variability of proteins, antigens, proteases, isoenzymes and nucleic acids

Os isolados de Giardia duodenalis de individuos assintomaticos, de pacientes e de animais apresentam diferencas e semelhancas em sua composicao proteica, expressao de antigenos, proteases e isoenzimas, assim como na constituicao dos acidos nucleicos. A presente revisao analisa estas diferencas com enfase na interacao parasita e hospedeiro, e nos possiveis mecanismos de virulencia do protozoario

Presencia de plasmidos de DNA de doble hebra en phaffia rhodozyma / Presence of double stranded plasmid DNA in phaffia rhodozyma

El análisis mediante electroforesis en gel de agarosa, de los ácidos nucleicos de tres cepas silvestres de phaffia rhodozyma, permitió determinar la presencia de elementos genéticos extracromosómicos de DNA de doble hebra en una de ellas, la cepa UCD 67-210. Esta cepa es portadora de al menos 6 bandas de DNA cromosómico y cuyos tamaños moleculares corresponden a 6.5, 5.9, 5.0, 4.4, 3,2 y 2.5 kb. Con el objetivo de determinar el tipo de ácido nucleico que constituye estos elementos, se estudió su comportamiento frente a diferentes nucleasas. El tratamiento con ribonucleasa A, ya sea en alta o baja fuerza iónica, no tiene efecto sobre las bandas electroforéticas, así como el tratamiento con nucleasa SI. Por el contrario, el tratamiento con desoxiribonucleasa pancreática conduce a una degradación completa de las bandas y del DNA cromosómico. Estos resultados sugieren que la naturaleza química de los plásmidos corresponde a DNA de doble hebra. Por otra parte, la visualización de los plásmidos en gel de agarosa, depende de la utilización de proteinasa K y SDS en el procedimiento de purificación de los plásmidos y en las condiciones de corrida electroférica, sugiriendo la presencia de un complejo DNA plásmidial-proteína en cada uno de estos elementos. Finalmente, el análisis mediante enzimas de restricción de dos de estos plásmidos, sugiere que estos elementos no están relacionados

role of plant growth regulators on spore germination, dry weight and nucleic acids content of pathogenic fungus rhizopus stolonifer

The effect of two plant growth regulator substances [GA3 and IAA] on spore germination, dry weight and nucleic acid content has been investigated on the growth of pathogenic fungus Rhizopus stolonifer/At low concentrations of both susbtances [GA3 and IAA] no stimulatory effect was observed on vegetative growth and nucleic acids content, while a gradual inhibition was observed at high concentration. The only stimulatory effect with both substances [GA3 and IAA] was detected on sporangiospore germination of Rhizopus stolonifer at the range of concentration between 10 and 100 ppm. Higher concentration showed a delay of germination

Status of nucleic acids and some related enzymes in rat spleen stressed with nitrosamine

Nucleic acids [DNA and RNA] were determined in spleen tissues of four groups of rats: control [normal diet] rat, rat fed on 70% normal diet + 30% soybean, rat fed on normal diet but supplied with drinking water contains nitrosamine, and rat fed on 70% normal diet + 30% soybean and drinking water.contains nitrosamine. The experimental period was 9 months, but the treatment with nitrosamine was for 6 months. Nitrosamine tends to increase RNA amounts after 3 months and increases DNA amount after the same period. The activity of endonuclease, nuclease, RNase A and RNase T1 was increased after 3 months as a result of the stress factor, but after 9 months, all the activities were inhibited in addition to the activities of DNase I. The treatment with nitrosamine for 9 months inhibited the nucleic acid formation. Total proteins in the tissue were reduced as a result of nutrosamine treatment

A protein concentrate from distillery yeast, and its application to supplement corn tortillas

El objetivo de este estudio fue el de aumentar la calidad proteínica de las tortillas, suplementándolas con un concentrado proteínico obtenido a partir de crema de levadura (Saccharomyces cerevisiae) proveniente de una planta procesadora de alcohol y ron. Se determinó la forma más eficiente de lograr un alto porcentaje de rompimiento de la pared celular de la levadura seca, y a partir del sobrenadante libre de paredcelular, se estableció el procedimiento para la obtención de un concentrado proteínico con bajo nivel de ácidos nucléicos. Durante la obtención del concentrado proteínico, los ácidos nucléicos se redujeron 91%, y la proteína aumentó 55% con respecto a la levadura inciial. A la masa de maíz variedad "Nutricta" se agregaron diferentes niveles de concentrado proteínico, las tortillas preparadas fueron sometidas a evaluación sensorial, y los resultados obtenidos se analizaron estadísticamente. Se estableció que el nivel máximo de aceptabilidad que no alteraba las propiedades organolépticas de las tortillas era de 18% (base seca). En las tortillas con el nivel máximo de concentrado proteínico establecido, el contenido de proteína (60%), se incrementó respecto a la tortilla control. Se obtuvo, además, un aumento significativo de lisina. El contenido de ácidos nucléicos fue bajo, por lo que éstos ya no constituyen en factor limitantes para el uso de la levadura en un producto destinado al consumo humano

CIBSOFT: Un paquete de programas para el análisis de ácidos nucleicos y proteínas / CIBSOFT: a set of programs for the analysis of nucleic acids and proteins

Presentamos un conjunto de programas en forma de menú para el análisis y la manipulación de secuencias de ADN, que contiene las opciones más útiles y de mayor uso de trabajos similares publicados como son: análisis de restricción, traducción a aminoácidos, uso de codones, búsqueda de marcos abiertos de lectura y un editor de secuencias de ADN. Los programas están al alcance de personas sin conocimientos de programación